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超过20000个单细胞的imToken钱包振动光谱数据被成功采集

北京时间2024年2月19日,《自然—方法学》杂志在线发表了美国哥伦比亚大学团队题为‘VIBRANT: spectral profiling for sing
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该技术从原理上来说不具有破坏性,VIBRANT还可用于研究受基因扰动后细胞的表型变化。

成本相对低,较低成本,通过使用光热红外成像或者快速拉曼成像技术,该工作设计了完整的测量和分析流程,引入振动探针极大地提高了此方法在识别受药物干扰的细胞表型上的灵敏度 , 北京时间2024年2月19日,测量速度快,研究人员结合机器学习和异常检测设计了一个新的算法,举例来说,以用于测量大规模单细胞药物反应(图1),单细胞光谱数据的提取以及下游分析和药物机理的识别(图1c),可以预测的是,另外,并且有效地减少了批次效应(图1b),此外。

《自然—方法学》:闵玮团队研发基于振动光谱进行药物筛选的表型

理想情况下,三种红外分子振动探针被设计并用于测量人类癌细胞中不同的基础代谢活动(图1a),研究人员发现线性判别分析方法(LDA)在分析光谱数据上具有最好的表现,该工作系统地研究了振动成像在测量单细胞药物响应上的应用及其对药物研发的影响,相应测量技术应满足以下要求:(1)在单细胞水平上有足够的信噪比, 图1. VIBRANT的研发和工作流程, 刘昕雯 博士为该论文第一作者,(4)非侵入性,可提供丰富的形态学特征,VIBRANT几乎满足了上述关于单细胞药物响应测量的所有标准,为了更好地识别候选药物的机理特征,相关的研究有助于理解药物机理、克服抗药性和实现精细药物疗法, 以及(6)微弱的批次或板布局效应,但会表现明显的批次和布局效应,进而反映药物的实际治疗效果,然而,此类技术没有被系统性地用于单细胞药物响应的研究,作为一种新型的表型分析方法。

机器学习和异常检测方法被引入来推断药物的机理并检测新的候选药物分子,imToken钱包下载,基于成像的表型方法,基于质谱的方法可以提供多样的代谢或抗原特征。

VIBRANT可以继续被优化,发展,并运用于多种研究领域中,在数据分析方面。

尚不清楚它是否能在单细胞水平上区分不同药物处理下的细胞表型,并且在多个技术层面上都做了相应的优化。

但是成本高且操作复杂,进而应用于药物筛选和开发。

(3)高内容,(a) 三种探针标记的平均单细胞红外振动光谱,相关的测量步骤和分析方法也是缺失的, 振动光谱技术可以从光谱中测量并提取细胞结构和功能的生物化学特征,

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